Perguruan tinggi swasta ini menawarkan 19 prodi, baik dari bidang sosial maupun sains dan teknologi.
Berada di Manokwari, Papua Barat, STKIP Muhammadiyah Manokwari merupakan salah satu kampus swasta Krismuha di bawah naungan Muhammadiyah.
Kampus yang berdiri sejak 2007 ini menyediakan lima prodi bagi mahasiswa yang memiliki keinginan menuntut ilmu di bidang pendidikan.
Kampus yang mendapat julukan Kristen Muhammadiyah selanjutnya, yakni Universitas Muhammadiyah Papua di Jayapura, Papua.
Hingga kini, universitas yang berdiri sejak 2001 ini menyediakan satu prodi D3, enam prodi S1, serta satu prodi pascasarjana.
Universitas Muhammadiyah Kupang atau UMK merupakan perguruan tinggi swasta milik Persyarikatan Muhammadiyah yang berkedudukan di Kupang, NTT.
Perguruan tinggi swasta ini memiliki lima fakultas dengan beragam program studi, termasuk Agama Islam, Ekonomi, dan Perikanan.
STKIP Muhammadiyah Kalabahi di Alor, NTT merupakan perguruan tinggi yang bermula dari kerja sama pemerintah daerah Kabupaten Alor dengan UMK pada 1997.
Dikutip dari laman resmi, kerja sama tersebut bertujuan untuk meningkatkan sumber daya manusia, khususnya pegawai negeri sipil (PNS) Kabupaten Alor.
Seiring berjalannya waktu, pimpinan daerah Kabupaten Alor atas nama Yayasan Persyarikatan Muhammadiyah mengajukan izin pendirian STKIP Muhammadiyah Kalabahi kepada Menteri Pendidikan Republik Indonesia.
Hingga pada 2015, proses penyelenggaraan akademik pun dibuka untuk pertama kali pada 2015.
Satu lagi kampus Kristen Muhammadiyah di NTT, yakni Universitas Muhammadiyah Maumere di Kabupaten Sikka.
Kampus yang naik kelas dari institut keguruan menjadi universitas ini tercatat memiliki dua fakultas, Pendidikan Matematika dan IPA serta Pendidikan Ilmu Sosial dan Humaniora.
Julukan kampus Krismuha juga melekat pada Universitas Muhammadiyah Manado, Sulawesi Utara.