Setelah perang kemerdekaan, Sugiyono menjabat sebagai Komandan Kompi 4 Batalyon 411 Brigade C di Purworejo.
Tahun 1955, ia menjabat sebagai kapten.
Semasa menjadi kapten, Sugiyono ditugaskan di Batalyon 436 di Magelang.
Tiga tahun berselang, 1958, Sugiyono diangkat sebagai Wakil Komandan Batalyon 411 di Semarang.
Kemudian, sejak Mei 1961, ia memegang jabatan sebagai Komandan Batalyon 411/Banteng Raiders III berpangkat Mayor.
Selanjutnya, ia menjadi Komandan Kompi 0718 di Pati.
Terakhir, Sugiyono ditugaskan di Yogyakarta dan menjabat sebagai Komandan Kodim.
Ia juga merangkap menjadi Pejabat Sementara Kepala Staf 072.
Baca juga: Abdul Wahid Hasjim: Masa Muda, Kiprah, dan Akhir Hidupnya
Pada 1 Oktober 1965 pukul 04.00 WIB, Sugiyono sudah pergi meninggalkan Yogyakarta menuju ke Pekalongan.
Ia sempat singgah di Semarang.
Saat di Semarang, Sugiyono mendapat kabar bahwa komandannya, Kolonel Katamso, sedang berada di Kentungan.
Sugiyono pun memutuskan untuk kembali ke Yogyakarta. Di tengah perjalanan, ia bertemu dengan Pangdam VII Suryosumpeno.
Ia pun menyarankan Sugiyono agar tidak kembali ke Yogyakarta, namun Sugiyono tidak menghiraukan imbauan tersebut.
Setibanya di Yogyakarta, Sugiyono langsung menuju ke rumah Kolonel Katamso.
Saat itulah ia mendengar bahwa Katamso telah diculik.