Teknologi Pengurutan Genom Ilmuwan Australia, Melacak Covid-19 Lebih Cepat

"Setelah mengambil sampel, mereka kemudian menambahkan beberapa bahan kimia yang dapat membongkar virus dan melepaskan RNA kecil di dalamnya," kata Dr Rowena seperti dikutip dari ABC.

Setelah memiliki urutan genetik kasus Covid-19, maka peneliti akan membandingkan materi itu dengan kasus yang sudah diketahui, dengan tujuan untuk mencari kemungkinan sumbernya.

Pada 3 November lalu, kasus Covid-19 baru telah berhasil diurutkan genomnya hanya dalam waktu beberapa jam.

Selanjutnya, hasil tersebut dicocokkan dengan dua database internasional yang disebut GISAID dan databaze lokal yang disebut AusTracker.

Baca juga: LIPI Berhasil Urutkan Genom Virus Corona SARS-CoV-2, Apa Manfaatnya?

Basis data tersebut, berisi urutan genetik kasus Covid-19 dari semua negara yang berpartisipasi.

Pengurutan genom dan pelacakan kontak telah semakin meningkat selama pandemi Covid-19 terjadi.

Kunci untuk mempercepat proses pemetaan penularan Covid-19 adalah teknologi pengurutan genom yang disebut nanopore.

Teknologi nanopore adalah yang digunakan untuk sekuensing genom yang dikembangkan Oxford dan sebenarnya telah berusia hampir satu dekade.

Baca juga: Sekuensing Genom Corona SARS-CoV-2, Ini Manfaatnya bagi Indonesia

Akan tetapi, saat ini teknologi tersebut hanya terbatas pada laboratorium-laboratorium terbaik.

Kendati metode ini dikhawatirkan tidak seakurat metode lain seperti Illumina, namun teknologi tersebut unggul dalam durasi waktu penyelesaian yang jauh lebih cepat.

Kolaborasi para ilmuwan Garvan Institute dan Kirby, serta Depkes NSW telah membuktikan manfaat menggunakan pengurutan nanopore, ketika sampel diperlakukan dengan cara tertentu dan dianalisis dengan benar

Para ilmuwan ini membuktikan studi teknologi pengurutan genom nanopore yang telah dipublikasikan dalam jurnal Nature Communications, dalam melacak Covid-19, meski cepat tetap tidak mengorbankan akurasi hasilnya.