Bukti Baru: Ditemukan Virus Corona Kerabat Dekat SARS-CoV-2 pada Kelelawar

KOMPAS.com - "Bagaimana virus corona berevolusi", adalah pertanyaan sederhana yang masih belum diketahui jawabannya hingga saat ini. Pertanyaan ini melahirkan banyak penyelidikan, spekulasi, hingga teori konspirasi.

Saat ini, studi menunjukkan bahwa virus yang bertanggung jawab atas penyakit Covid-19 berevolusi secara alami. Virus corona tidak berasal dari laboratorium.

Mungkin virus ini benar berasal dari kelelawar, menular ke hewan, dan bermutasi hingga menjadikan pandemi global seperti saat ini.

Sebuah studi baru menguatkan teori tersebut.

Tim ilmuwan dari China menemukan adanya kerabat dekat virus SARS-CoV-2 dalam kelelawar.

Mereka juga menemukan mutasi yang merupakan penyisipan materi genetik ke dalam genom virus yang menunjukkan bahwa perubahan virus itu memang terjadi secara alami.

"Sejak ditemukannya virus corona SARS-CoV-2, ada sejumlah teori tidak berdasar yang mengungkap bahwa virus corona baru berasal dari laboratorium," ungkap ahli mikrobiologi dari Shandong First Medical University, Weifing Shi.

"Secara khusus, telah diusulkan penyisipan S1/S2 sangat tidak biasa dan mungkin merupakan indikasi manipulasi laboratorium. Tapi makalah kami menunjukkan dengan sangat jelas bahwa virus corona secara alami berasal dari satwa liar. Ini memberi bukti kuat bahwa SARS-CoV-2 bukan buatan laboratorium," imbuh Weifeng Shi dilansir Science Alert, Selasa (12/5/2020).

Virus yang baru ditemukan pada kelelawar ini, oleh tim Weifeng Shing dinamai RmYN02.

Diidentifikasi selama analisis terhadap 302 sampel dari 227 kelelawar yang berasal dari provinsi Yunnan, China, pada paruh kedua 2019.

Setelah menganalisis virus yang ditemukan dalam sampel kelelawar, tim akhirnya mengungkap dua genom virus corona yang hampir lengkap, yakni RmYN01 dan RmYN02.

RmYN01 hanya memiliki kecocokan rendah dengan SARS-CoV-2. Namun RmYN02 sangat mirip dengan SARS-CoV-2.

Virus corona RmYN02 memiliki 93,3 persen genom yang sama dengan SARS-CoV-2, dan satu gen tertentu yang disebut 1ab berbagi 97,2 persen. Ini adalah kecocokan terdekat dalam gen tersebut hingga saat ini.

Lalu ada acara penyisipan. RmYN02 mengandung insersi asam amino pada titik di mana dua subunit (S1 dan S2) dari protein lonjakan bertemu.

SARS-CoV-2 juga memiliki insersi S1 dan S2 - mereka bukan asam amino yang sama dalam kedua virus, tetapi ini menunjukkan bahwa insersi ini dapat terjadi secara alami, tidak memerlukan laboratorium.

Meskipun memiliki kesamaan, itu tidak berarti RmYN02 adalah leluhur langsung dari virus yang menyebabkan COVID-19 di seluruh dunia.

Terutama mengingat gen untuk domain pengikatan reseptor yang sangat penting memiliki kecocokan yang sangat rendah dengan SARS-CoV-2, di hanya 61,3 persen.

Tetapi menemukan genom coronavirus baru sangat membantu jika kita ingin mengetahui bagaimana virus SARS-CoV-2 berevolusi menjadi seperti sekarang ini.

"Studi kami menegaskan kembali bahwa kelelawar, khususnya genus Rhinolophus (kelelawar tapal kuda), adalah reservoir (sarang) alami yang penting untuk virus corona dan saat ini menampung kerabat terdekat SARS-CoV-2, meskipun gambar ini dapat berubah dengan meningkatnya pengambilan sampel satwa liar," tim tersebut menulis dalam studi mereka.

"Kami menemukan sesuatu yang sangat mengejutkan, di mana virus RmYN02 yang diidentifikasi ada pada Rhinolophus malayanus adalah kerabat terdekat SARS-CoV-2 dalam gen replikasi 1ab panjang, meskipun virus itu sendiri memiliki sejarah rekombinasi yang kompleks."

Ini merupakan kecocokan terdekat dengan SARS-CoV-2 yang ditemukan ilmuwan sejauh ini. Itu adalah virus korona kelelawar bernama RaTG13 - 96,1 persen dari kecocokan RNA-nya, tetapi kemungkinan ada lebih banyak virus di luar sana.

"Baik RaTG13 maupun RmYN02 adalah leluhur langsung dari SARS-CoV-2, karena masih ada celah evolusi antara virus-virus ini," Shi menjelaskan.

"Studi kami sangat menyarankan bahwa pengambilan sampel lebih banyak pada spesies satwa liar akan mengungkapkan virus yang bahkan lebih dekat hubungannya dengan SARS-CoV-2 dan bahkan mungkin nenek moyang langsungnya, yang akan memberi tahu kita banyak tentang bagaimana virus ini muncul pada manusia."

Penelitian ini telah dipublikasikan dalam Current Biology.

Setidaknya hingga Rabu (13/5/2020), virus ini telah menginfeksi lebih dari 4,3 juta orang dan membunuh hampir 293 ribu jiwa di seluruh dunia.