Pada periode selanjutnya, ia menjabat sebagai Wakil Ketua DPRD Provinsi Papua Barat.
Pada periode ini juga, Jimmy dipilih menjadi Ketua DPD PDI-P Papua Barat.
Pada 2014, ia terpilih menjadi Anggota DPR RI periode 2014-2019.
Namun, karena kasus dugaan korupsi yang menjeratnya, Jimmie gagal dilantik pada 2014 bersama empat anggota lainnya.
Harian Kompas, 1 Oktober 2014, memberitakan, Jimmy saat itu berstatus sebagai terdakwa kasus dugaan korupsi dana pinjaman dari PT Padoma sebesar Rp 22 miliar.
Setelah mengajukan upaya hukum kasasi ke Mahkamah Agung (MA) pada tahun 2016, MA memutuskan bahwa Jimmy tidak bersalah.
Ia pun akhirnya dilantik sebagai Anggota DPR RI pada tahun 2017 berdasarkan Surat Keputusan Presiden nomor 80/P2017.
Jimmy awalnya bertugas di Komisi II bidang kepemiluan, otonomi daerah, dan reforma agraria.
Pada Januari 2018, terjadi mutasi internal partai dan Jimmy berpindah tugas ke Komisi I yang membidangi intelijen, luar negeri dan pertahanan.
Simak breaking news dan berita pilihan kami langsung di ponselmu. Pilih saluran andalanmu akses berita Kompas.com WhatsApp Channel : https://www.whatsapp.com/channel/0029VaFPbedBPzjZrk13HO3D. Pastikan kamu sudah install aplikasi WhatsApp ya.