Dari Alpha sampai Lambda, Ini Nama dan Varian Lengkap SARS-CoV-2

KOMPAS.com - Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) mengumumkan bahwa ada dua varian virus corona yang pertama kali ditemukan di India akan dinamai sebagai "Delta" dan "Kappa".

"Varian Covid-19 yang pertama kali ditemukan di India akan disebut sebagai 'Delta', sedangkan varian yang ditemukan sebelumnya di negara itu akan dikenal sebagai 'Kappa'," ujar WHO mengutip CNBC, Selasa (1/6/2021).

Menurut WHO, lebel atau penamaan, baru dipilih setelah adanya diskusi dan peninjauan dari banyak sistem penamaan potensial.

Technical Lead Covid-19 WHO, Dr maria Van Kerkhove menyampaikan bahwa adanya label tidak menggantikan nama ilmiah yang ada.

Namun, hal ini menyampaikan informasi ilmiah penting dan akan terus digunakan dalam penelitian.

"Tidak ada negara yang harus distigmatisasi untuk mendeteksi dan melaporkan varian Covid-19," ujar Maria.

Penamaan varian SARS-CoV-2

Dilansir dari situs resmi WHO, sistem tata nama yang ditetapkan untuk penamaan dan pelacakan garis keturunan genetik SARS-CoV-2 dilakukan oleh GISAID, Nextstrain, dan Pango.

Nextstrain adalah proyek sumber terbuka untuk memanfaatkan potensi ilmiah dan kesehatan masyarakat dari data genom patogen.

Mereka berkolaborasi dengan peneliti di Seattle, USA, dan Basel.

Sementara, Pango adalah singkatan dari Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages (PANGOLIN).

Saat ini, kelompok pakar yang dibentuk oleh WHO ini telah merekomendasikan penggunaan label yang menggunakan huruf Alfabet Yunani, yaitu Alpha, Beta, Gamma, yang akan lebih mudah dan praktis untuk dibahas oleh audiens non-ilmiah.

Update Varian SARS-CoV-2

Berdasarkan update WHO per 31 Mei 2021, ada dua jenis varian yang membedakan yakni variants of concern (varian kepedulian) dan variants of interest (varian minat).

Variants of concern

WHO menuliskan bahwa varian SARS-CoV-2 ini yang memenuhi definisi varian yang diminati dan melalui penilaian komparatif, serta telah terbukti terkait dengan satu atau lebih dari perubahan pada tingkat kesehatan masyarakat global.

Adapun perubahannya, yakni:

Adapun virus yang termasuk variant of concern yakni:

1. Alpha (penamaan WHO) atau B.1.1.7 (penamaan Pango), ditemukan sampel di Inggris pada September 2020, dan ditunjukkan pada 18 Desember 2020.

2. Beta (penamaan WHO) atau B.1.351 (penamaan Pango), ditemukan sampel di Afrika Selatan pada Mei 2020, dan ditunjukkan pada 18 Desember 2020.

3. Gamma (penamaan WHO) atau P.1 (penamaan Pango), ditemukan sampel di Brasil pada November 2020, dan ditunjukkan pada 11 Januari 2021.

4. Delta (penamaan WHO) atau B.1.617.2 (penamaan Pango), ditemukan sampel di India pada Oktober 2020, dan ditunjukkan pada 4 April 2021 (VOI) dan 11 Mei 2021 (VOC).

Variants of interest

Sementara, isolat SARS-CoV-2 adalah Variant of Interest (VOI) jika, dibandingkan dengan isolat referensi, genomnya memiliki mutasi dengan implikasi fenotipik yang telah ditetapkan atau masih dugaan.

Selain itu virus yang termasuk dalam VOI ini merupakan salah satu dari:

Adapun virus yang termasuk variant of interest, antara lain:

1. Epsilon (penamaan WHO) atau B.1.427/B.1.429 (penamaan Pango), ditemukan sampel di AS pada Maret 2020, dan ditunjukkan pada 5 Maret 2021.

2. Zeta (penamaan WHO) atau P.2 (penamaan Pango), ditemukan sampel di Brasil pada April 2020, dan ditunjukkan pada 17 Maret 2021.

3. Eta (penamaan WHO) atau B.1.525 (penamaan Pango), ditemukan sampel di banyak negara pada Desember 2020, dan ditunjukkan pada 17 Maret 2021.

4. Theta (penamaan WHO) atau P.3 (penamaan Pango), ditemukan sampel di Filipina pada Januari 2021, dan ditunjukkan pada 24 Maret 2021.

5. Iota (penamaan WHO) atau B.1.526 (penamaan Pango), ditemukan sampel di AS pada November 2020, dan ditunjukkan pada 24 Maret 2021.

6. Kappa (penamaan WHO) atau B.1.617.1 (penamaan Pango), ditemukan sampel di Brasil pada Oktober 2020, dan ditunjukkan pada 4 April 2021.

7. Lambda (penamaan WHO) atau C.37 (penamaan Pango), ditemukan sampel di Peru pada Agustus 2020, dan ditunjukkan pada 14 Juni 2021.