Beberapa kontribusi Hekinus Manaö yakni aturan Standar Akuntansi Pemerintahan (SAP) berbasis cash toward accrual yang diakui dunia internasional. Dia juga memimpin penyusunan Laporan Keuangan Pemerintah Pusat (LKPP) yang lengkap pada 2004 untuk pertama k