Berdasarkan hitung cepat, pasangan cagub-cawagub Pilkada Ambon Said Assagaf-Zeth Sahuburua (Setia) memperoleh 51.05 persen suara. Sementara pesaingnya, Abdullah Vanath-Martin Jonas Maspaitela (Damai), memperoleh 48,95 persen.
Pelaksanaan pemilihan ulang di Tempat Pemungutan Suara (TPS) 36 Desa Gamsungi, Kecamatan Tobelo Halmahera Utara, Maluku Utara dilaksanakan, Sabtu (6/7/2013), namun sangat sedikit warga yang hadir.
Tiga Polda yakni Polda Sulawesi Utara, Polda Gorontalo dan Polda Jawa Tengah mengirimkan bantuan personel Brimob ke Maluku Utara (Malut) untuk BKO (bantuan kendali operasi) dalam pengamanan pilkada setempat.