Kali ini anak perusahaan Lion Group yang berbasis di Malaysia itu memutuskan untuk mengoperasikan rute yang menghubungkan kota Pekanbaru dengan salah satu negara bagian di Malaysia, Melaka.
Malindo Air mulai menerbangi rute Kuala Lumpur-Jakarta pada 23 September 2013 dan Kuala Lumpur-Denpasar pada 26 September 2013. Penerbangan dilakukan setiap hari.