Tumpang tindih tanggung jawab antara pemerintah pusat dan Pemprov DKI kerap menjadi persoalan dalam pembangunan transportasi di area Jabodetabek. Pembangunan transportasi pun tidak merata.
Upaya pembenahan birokrasi Pemerintah Provinsi DKI Jakarta agar lebih bersih serta profesional merupakan salah satu janji yang diucapkan Jokowi-Basuki saat kampanye terdahulu